Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms