Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms