Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms