Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShprhQ7TPQ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ShprhQ7TPQ3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShprhQ7TPQ3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms