Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms