Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Atp8b3Q6UQ17 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Atp8b3Q6UQ17 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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