Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc154Q6RUT8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms