Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scaf4Q6PFF0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms