Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms