Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms