Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pprc1Q6NZN1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms