Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpbp1Q6NXH3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms