Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms