Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms