Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd9lQ69Z37 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samd9lQ69Z37 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms