Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms