Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms