Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3cQ62181 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms