Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms