Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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