Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms