Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox17Q61473 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms