Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf9Q61179 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf9Q61179 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms