Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.2 ms