Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3558Q5FWC9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3558Q5FWC9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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