Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms