Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox3Q3UT54 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms