Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms