Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms