Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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