Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp4Q3U4B1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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