Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem88bQ3TYP4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88bQ3TYP4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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