Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms