Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm1123Q1RME4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms