Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q08AU9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q08AU9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q08AU9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q08AU9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q08AU9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q08AU9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms