Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms