Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmn1Q05860 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fmn1Q05860 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms