Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms