Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Crisp3Q03402 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms