Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4A11Q02928 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms