Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snai1Q02085 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snai1Q02085 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snai1Q02085 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snai1Q02085 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snai1Q02085 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snai1Q02085 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms