Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RykQ01887 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RykQ01887 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RykQ01887 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RykQ01887 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms