Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SeleQ00690 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms