Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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