Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx3P81067 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms