Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HfeP70387 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HfeP70387 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HfeP70387 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HfeP70387 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HfeP70387 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HfeP70387 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HfeP70387 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HfeP70387 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms