Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps27aP62983 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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