Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd2P62317 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms