Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sem1P60897 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sem1P60897 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms