Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b6P59708 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms